Родился в Архангельске в 1926 году. На его долю пришлись и репрессия отца и Великая отечественная война. После войны Геннадий Анатольевич окончил Ярославское художественное училище и Академию художеств.
С 1951 года — участник областных, зональных, республиканских, всесоюзных и зарубежных художественных выставок.

Особенную славу принесла художнику картина «К сыну», она неоднократно репродуцировалась не только в художественных каталогах и журналах, но и в общественно-политических изданиях, иллюстрируя тему новой жизни ненецкой тундры. Хрестоматийную известность получила также картина «Проводы в школу», включенная в программу общеобразовательной школы. Геннадий Семаков — автор проекта памятника жертвам репрессий 20-50-х гг, установленном в 1992 году. Его работы хранятся в музеях Архангельска, Нарьян-Мара, Северодвинска, Калининграда, Чебоксар, г. Оулу (Финляндия).

Тонким лиризмом отличается эротическая серия картин, написанная в традиционной для художника манере с реалистическими перечислениями подробностей: композиция «В ожидании любви» (1994), «Кийский загар» (1993), «Не жизнь, а малина» (1995). В 90-е годы выставкой эротических картин художник был представлен в художественных галереях стран Баренц-региона (Финляндия, Норвегия, Швеция, Шотландия), стал участником электронного каталога (POLAR ARC art and artists from the European Arctic CD — ROM Финляндия, 1997).

16 января 2015 года, на 89-м году жизни Геннадий Анатольевич Семаков ушёл из жизни. За долгие годы творчества он создал десятки произведений: от небольших этюдов до монументальных полотен. Его работы хранятся в музеях многих городов России, галерее финского города Оулу, многие попали и в частные коллекции.